Differenze

Queste sono le differenze tra la revisione selezionata e la versione attuale della pagina.

--- matematica:asd:asd_15:progetto_15 [16/05/2016 alle 13:59 (10 anni fa)] – Roberto Grossi
+++ matematica:asd:asd_15:progetto_15 [16/05/2016 alle 19:40 (10 anni fa)] (versione attuale) – Roberto Grossi
@@ Linea 17: / Linea 17: @@
   * Un estratto della documentazione sul formato dei file presi da PDB è disponibile tramite {{:matematica:asd:asd_15:estrattodocpdb.pdf|questo link}}.
-Il grafo va costruito da un file di testo PDB come segue. I **vertici** sono gli atomi, descritti nelle linee ATOM. I campi di interesse sono "serial" (identificatore unico dell'atomo), "x", "y", "z" (sue coordinate cartesiane in angstrom) e "element" (simbolo dell'elemento associato all'atomo).
+Il grafo va costruito a partire da un file di testo PDB come segue. I **vertici** sono gli atomi, descritti nelle linee ATOM. I campi di interesse sono "serial" (identificatore unico dell'atomo), "x", "y", "z" (sue coordinate cartesiane in angstrom) e "element" (simbolo dell'elemento associato all'atomo).
 {{:matematica:asd:asd_15:atom.jpg?600|}}
@@ Linea 36: / Linea 36: @@
   * [1 ... 2] : legame covalente;
   * (2 ... 3,2] : legame non covalente;
-  * altrimenti, l'arco non esiste (la distanza è inferiore a 1, che viene considerata rumore, oppure la distanza è superiore a 3.2 angstrom e le forze sono troppo deboli).
+  * altrimenti : l'arco non esiste (la distanza è inferiore a 1, che viene considerata rumore, oppure la distanza è superiore a 3,2 angstrom e le forze sono troppo deboli).
 Nota. In alcuni file PDB, la proteina può essere stata replicata più volte: in tal caso è sufficiente prendere soltanto la componente connessa a partire dal primo vertice ATOM.
 Suggerimento. Ogni volta che viene trovato un SICC più grande, conviene stamparne subito la dimensione, in modo che il programma possa essere interrotto dopo un'ora senza perdere l'informazione calcolata fino a quel momento.